Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U3KQA8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQA8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQA8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQA8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQA8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U3KQA8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U3KQA8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U3KQA8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQA8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQA8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQA8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U3KQA8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQA8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQA8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQA8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQA8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
U3KQA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
U3KQA8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U3KQA8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U3KQA8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U3KQA8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U3KQA8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U3KQA8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U3KQA8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U3KQA8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U3KQA8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQA8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U3KQA8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQA8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQA8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U3KQA8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQA8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQA8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQA8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQA8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U3KQA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms