Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A4Q9Y6R1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A4Q9Y6R1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A4Q9Y6R1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms