Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCOA3Q9Y6Q9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NCOA3Q9Y6Q9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCOA3Q9Y6Q9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCOA3Q9Y6Q9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCOA3Q9Y6Q9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCOA3Q9Y6Q9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms