Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJA3Q9Y6H8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJA3Q9Y6H8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJA3Q9Y6H8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJA3Q9Y6H8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms