Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX10Q9Y5X0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX10Q9Y5X0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX10Q9Y5X0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX10Q9Y5X0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms