Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P6

GMPPB, Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPBQ9Y5P6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GMPPBQ9Y5P6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GMPPBQ9Y5P6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GMPPBQ9Y5P6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GMPPBQ9Y5P6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms