Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN16Q9Y5I7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN16Q9Y5I7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN16Q9Y5I7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms