Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP4S1Q9Y587 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP4S1Q9Y587 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP4S1Q9Y587 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms