Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
YIPF1Q9Y548 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
YIPF1Q9Y548 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YIPF1Q9Y548 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YIPF1Q9Y548 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms