Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NR2E1Q9Y466 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NR2E1Q9Y466 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NR2E1Q9Y466 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR2E1Q9Y466 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR2E1Q9Y466 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms