Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMED5Q9Y3A6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED5Q9Y3A6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.2 ms