Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y324

FCF1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCF1Q9Y324 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FCF1Q9Y324 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FCF1Q9Y324 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FCF1Q9Y324 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FCF1Q9Y324 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FCF1Q9Y324 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms