Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHDC2Q9Y2U9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHDC2Q9Y2U9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHDC2Q9Y2U9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms