Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SSUH2Q9Y2M2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSUH2Q9Y2M2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSUH2Q9Y2M2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSUH2Q9Y2M2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms