Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2BQ9UQN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP2BQ9UQN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2BQ9UQN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHMP2BQ9UQN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms