Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRIM35Q9UPQ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM35Q9UPQ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM35Q9UPQ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms