Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BSNQ9UPA5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BSNQ9UPA5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BSNQ9UPA5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BSNQ9UPA5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms