Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHTF1Q9UMS5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHTF1Q9UMS5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHTF1Q9UMS5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms