Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ALKQ9UM73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
ALKQ9UM73 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ALKQ9UM73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ALKQ9UM73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms