Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPCAL4Q9UM19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPCAL4Q9UM19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPCAL4Q9UM19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPCAL4Q9UM19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms