Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID1Q9ULK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID1Q9ULK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID1Q9ULK0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID1Q9ULK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms