Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES3Q9UL19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RARRES3Q9UL19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RARRES3Q9UL19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARRES3Q9UL19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms