Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
USP21Q9UK80 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP21Q9UK80 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP21Q9UK80 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USP21Q9UK80 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
USP21Q9UK80 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
USP21Q9UK80 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
USP21Q9UK80 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
USP21Q9UK80 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP21Q9UK80 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms