Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBD1Q9UJT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBD1Q9UJT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBD1Q9UJT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBD1Q9UJT1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms