Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATPIF1Q9UII2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATPIF1Q9UII2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms