Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MED13Q9UHV7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED13Q9UHV7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED13Q9UHV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms