Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TUBGCP4Q9UGJ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBGCP4Q9UGJ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBGCP4Q9UGJ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TUBGCP4Q9UGJ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms