Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms