Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CFDP1Q9UEE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CFDP1Q9UEE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CFDP1Q9UEE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFDP1Q9UEE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFDP1Q9UEE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFDP1Q9UEE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms