Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
MBD5Q9P267 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MBD5Q9P267 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MBD5Q9P267 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MBD5Q9P267 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
MBD5Q9P267 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MBD5Q9P267 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms