Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC88CQ9P219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC88CQ9P219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC88CQ9P219 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms