Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZSWIM5Q9P217 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZSWIM5Q9P217 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZSWIM5Q9P217 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSWIM5Q9P217 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSWIM5Q9P217 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms