Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA3Q9NZ52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
GGA3Q9NZ52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGA3Q9NZ52 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GGA3Q9NZ52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GGA3Q9NZ52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms