Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDL2Q9NX52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDL2Q9NX52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDL2Q9NX52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms