Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM39AQ9NV64 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM39AQ9NV64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39AQ9NV64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39AQ9NV64 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms