Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SH2B1Q9NRF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH2B1Q9NRF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH2B1Q9NRF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms