Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CHST12Q9NRB3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHST12Q9NRB3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHST12Q9NRB3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms