Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN4Q9NQP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFDN4Q9NQP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PFDN4Q9NQP4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PFDN4Q9NQP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms