Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM60AQ9NP50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM60AQ9NP50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM60AQ9NP50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM60AQ9NP50 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms