Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CLSPNQ9HAW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLSPNQ9HAW4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLSPNQ9HAW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms