Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ELP3Q9H9T3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ELP3Q9H9T3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ELP3Q9H9T3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELP3Q9H9T3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELP3Q9H9T3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms