Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12BQ9H7P6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12BQ9H7P6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12BQ9H7P6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVB12BQ9H7P6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms