Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
REEP4Q9H6H4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REEP4Q9H6H4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms