Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM6SF2Q9BZW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM6SF2Q9BZW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM6SF2Q9BZW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms