Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PACSIN1Q9BY11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PACSIN1Q9BY11 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PACSIN1Q9BY11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms