Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf16Q9BUW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf16Q9BUW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf16Q9BUW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf16Q9BUW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms