Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C20orf78Q9BR46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C20orf78Q9BR46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C20orf78Q9BR46 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms