Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLSTN3Q9BQT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN3Q9BQT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLSTN3Q9BQT9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3Q9BQT9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms