Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SGIP1Q9BQI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SGIP1Q9BQI5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SGIP1Q9BQI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SGIP1Q9BQI5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms