Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL2Q99962 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL2Q99962 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL2Q99962 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms